Năm 2019, tiến sĩ Đào Nguyên Khôi được Hội đồng giáo sư nhà nước công nhận đạt chuẩn chức danh phó giáo sư. Cũng trong năm này, ông là một trong 10 tài năng khoa học trẻ Việt Nam được nhận Giải thưởng khoa học công nghệ thanh niên Quả cầu vàng, do Trung ương Đoàn cùng Bộ Khoa học và Công nghệ trao tặng. Ông cũng là một trong 12 "Công dân trẻ tiêu biểu TP.HCM" năm 2019.đăng ký nhận 88k cwin